Летопись войн в школе Мурё

Старшеклассник Шиничи Кудо обладает высоким интеллектом и помогает полиции в расследовании сложных дел. После случайного наблюдения за незаконной сделкой членов преступной организации он был схвачен. Преступники заставили его принять экспериментальную таблетку, после чего он потерял сознание. Придя в себя, Кудо обнаружил, что его тело физически уменьшилось до размеров семилетнего ребенка.

Чтобы скрыться от преследования и сохранить свою жизнь, Шиничи принимает решение изменить личность. Он находит убежище в доме своей подруги детства Ран Мори и представляется как Эдогава Конан. Отец Ран, Когоро Мори, работает частным детективом. Используя свои сохранившиеся аналитические способности и знания, Кудо начинает тайно помогать в расследованиях агентства, одновременно пытаясь найти способ вернуть себе прежнее тело и раскрыть деятельность преступной группы.