Инициал Ди: Экстра-стадия

Нагумо Киичиру в старших классах демонстрировал способности к аналитическому мышлению и расследованию преступлений. Его методы привлекали внимание как одноклассников, так и специалистов в области криминалистики. Спустя десять лет, в возрасте 35 лет, Нагумо управляет частным детективным агентством. Агентство испытывает финансовые трудности, связанные с оплатой аренды и накоплением долгов. Количество успешно раскрытых дел недостаточно для стабилизации положения.

В офис Нагумо приходит старшеклассница, которая предлагает свою помощь в качестве ассистента. Ее предложение основано на искреннем интересе к детективной работе и желании поддержать агентство. Она представляет новые подходы к расследованиям, отличающиеся от методов Нагумо. Перед детективом стоит выбор - принять помощь и попытаться использовать новые идеи для улучшения положения агентства, а также восстановить собственные профессиональные навыки.