Вперёд, Анпанман! Давайте победим корабль с привидениями!!

Алхимия представлена как дисциплина с четкими правилами и ограничениями. Основные законы запрещают нарушать природный баланс, создавая нечто из меньшего количества материала, а также строго воспрещают попытки сотворения человека. Братья Эдвард и Альфонс Элрик, изучавшие алхимию с детства, решаются нарушить этот главный запрет, чтобы воскресить свою умершую мать.

Попытка человеческого преобразования приводит к тяжелым последствиям: Эдвард теряет левую ногу, а Альфонс лишается всего физического тела, его душа перемещается в пустые доспехи. Стремясь исправить свою ошибку и вернуть Альфонсу прежнее тело, Эдвард становится государственным алхимиком. Это положение дает ему доступ к ресурсам и исследованиям, необходимым для поиска способа обратного превращения.